世界卫生组织认可艾灸的治疗功效，向全世界推介66种艾灸适应症。在几千年的灸疗实践中，中国人总结出了数百种病例。艾灸适合治疗的是一些寒性、虚性的疾病，主要以慢性疾病为主。
基本上可以把这些疾病分为四类：
1.关节性疾病
包括老年人退行性关节炎、关节活动障碍、肩周炎、腰椎病、颈椎等;办公室白领因工作性质导致的腰椎病、颈椎病需要经过医生辨证之后，才可判断是否适合艾灸。证型属于肝阳上亢型的关节性疾病是不适宜艾灸的。
2.消化系统疾病
包括十二指肠溃疡、慢性胃炎、慢性结肠炎、胃肠功能障碍等疾病;另外就是辨证为虚寒型的拉肚子、胃胀、胃痛，也可通过艾灸治疗。
3.杂病
例如一些常见的妇科、男科疾病，慢性盆腔炎、前列腺炎等。还有一些属于虚寒型的症状如小便清长、腰膝酸软、下腹坠胀等也属于艾灸的治疗范围。
4.顽固性疾病
包括强直性脊柱炎，一些通过中医的辨证，属于虚寒性的诊断不明，没有办法解释的功能性疾病。
艾灸治疗疾病是从辨证论治的角度出发的，即便是同一个疾病，选取的穴位也可能有所不同，所以要严格根据疾病来分艾灸穴位的话，比较难。但是可以根据疾病类型选取一些通用的穴位，来达到保健和防治的作用。
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